Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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CUL4AQ13619 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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CUL4AQ13619 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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CUL4AQ13619 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL4AQ13619 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
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