Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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