Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MSLNQ13421 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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