Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms