Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR5A1Q13285 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR5A1Q13285 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms