Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3FQ13275 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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