Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3BQ13214 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms