Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CHAF1BQ13112 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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