Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms