Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRDM2Q13029 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
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