Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms