Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms