Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL30Q0D2K2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms