Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPAL4Q0D2K0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms