Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN5Q08AF3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms