Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms