Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
COL16A1Q07092 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL16A1Q07092 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms