Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms