Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC9Q06265 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms