Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms