Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms