Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN12Q05209 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms