Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms