Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERCC6Q03468 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms