Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDR2Q01850 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms