Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms