Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAP1Q01518 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAP1Q01518 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms