Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSF1Q00613 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms