Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms