Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD1P98174 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD1P98174 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms