Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC1P78348 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms