Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB11AP62491 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms