Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UFM1P61960 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms