Protein–RNA interactions for Protein: P60827

C1QTNF8, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF8P60827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QTNF8P60827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF8P60827 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF8P60827 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF8P60827 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms