Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms