Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABP4P57796 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABP4P57796 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABP4P57796 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms