Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEFSECP57772 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms