Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNQ4P56696 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNQ4P56696 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms