Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARFIP1P53367 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms