Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms