Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND2P52198 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RND2P52198 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RND2P52198 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND2P52198 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms