Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATMP50440 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATMP50440 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATMP50440 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATMP50440 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATMP50440 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATMP50440 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms