Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NESP48681 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NESP48681 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NESP48681 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NESP48681 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NESP48681 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NESP48681 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NESP48681 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NESP48681 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NESP48681 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NESP48681 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NESP48681 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms