Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA8P48165 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA8P48165 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA8P48165 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA8P48165 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA8P48165 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA8P48165 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA8P48165 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA8P48165 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA8P48165 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA8P48165 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms