Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRKLP46109 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRKLP46109 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRKLP46109 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRKLP46109 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRKLP46109 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRKLP46109 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRKLP46109 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRKLP46109 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRKLP46109 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRKLP46109 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRKLP46109 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms