Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCCP43146 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCCP43146 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCCP43146 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCCP43146 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCCP43146 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCCP43146 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DCCP43146 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DCCP43146 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCCP43146 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms