Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIFRP42702 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIFRP42702 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIFRP42702 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms