Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPOP42166 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPOP42166 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPOP42166 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPOP42166 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms