Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms