Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT2P35908 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT2P35908 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT2P35908 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms